Không gian văn hóa là nơi diễn ra nhiều hoạt động như: trưng bày mô hình Châu ấn thuyền; tổ chức trưng bày tư liệu lịch sử, kết quả khảo cổ học về giao thương, về mối quan hệ của phố Nhật ở Hội An thế kỷ 17; trình diễn, dịch vụ trà đạo, trà xanh Nhật Bản;  trò chơi trẻ em Việt Nam và Nhật Bản; trò chơi gấp giấy Origami; trình diễn hoạt cảnh “Trang phục Hội An - Ký ức thời gian” và giới thiệu trang phục Nhật Bản; trình diễn nhạc cụ dân tộc Việt Nam và Nhật Bản; lớp học hát dân ca Việt Nam; trình diễn, dịch vụ Thư pháp Việt Nam và Nhật Bản; dịch vụ xe cổ - mặc trang phục Nhật Bản (yukata, kimono) và xe cổ - mặc trang phục Việt Nam (áo dài, bà ba…); thả hoa đăng Nhật Bản và Việt Nam trên sông Hoài; hướng dẫn tham quan tour “Dấu xưa Nhật Bản”….  
Hiện nay, ngôi nhà số 6 Nguyễn Thị Minh Khai, được TTQLBTDS phối hợp nghiệm thu, bàn giao đưa vào sử dụng. UBND TP. Hội An thống nhất làm nơi tổ chức hoạt động “Không gian văn hóa Việt Nam- Nhật Bản” cùng với di tích đình Cẩm Phô để nhân dân và du khách tìm hiểu, trải nghiệm về văn hóa xứ sở Hoa anh đào, cũng như thắt chặt hơn mối quan hệ hữu hảo giữa hai quốc gia Việt Nam- Nhật Bản và giữa Hội An- Nagasaki.